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El área de de Conservación Guanacaste (ACG) se maneja como una sola unidad dividida en sectores o secciones - dentro de los cuales se incluyen estaciones biológicas - y en un una estación experimental forestal; cada sección está a cargo de un administrador. Los parques Guanacaste y Santa Rosa constan de las siguientes 9 secciones: Santa Rosa, Naranjo; Murciélago, Islas Murciélago, Pocosol, El hacha, Pitilla, Orosí y Cacao.
La mayor parte de estos parques se localiza en la meseta de Santa Rosa, un producto de depósitos de nubes ardientes de 3-4 millones de años de antigüedad, que corresponde con la región climática denominada Pacífico Seco. Algunos de los hábitat más reconocibles que se encuentran aquí, son los antiguos pastizales, ralamente cubiertos por una gramínea procedente de áfrica, el jaragua (Hyparrhenia rufa) y salpicados por diversas especies de árboles pioneros, como el raspaguacal (Curatella americana) que terminarán por eliminar el pasto; los bosques deciduos, con unas 240 especies de árboles y arbustos, entre ellos el guanacaste (Enterolobium cyclocarpum), - el árbol nacional - , el cocobolo (Dalbergia retusa), la caoba (Swietenia marcophylla) - especie en peligro de extinción - y Ateleia herbert-smithii, cuya única localidad conocida es el Parque Santa Rosa; los bosques de encino (Quercus oleoides), los bosques siempre verdes y los bosques ribereños, donde se observan el guapinol (Hymenaea courbaril) y el ojoche (Brosimum alicastrum); los pantanos de mezquite-nacascol (Prosopis juliflora-Caesalpinia coriaria); los bosques achaparrados, muy espinosas, donde se pueden observar ágaves y cactos; la vegetación de playa y los manglares con especies como el mangel rojo (Rhizophora mangle) y el palo de sal (Avicennia germinans).
A esta variedad de hábitat corresponde una fauna rica y diversa. Tanto en el bosque seco como en el resto del ACG, se han observado 115 especies de mamíferos - de las que más de la mitad son murciélagos -; algunos de los más conspicuos son el venado (Odocoileus virginianus), el pizote (Nasua narica) y el mono congo (Alouatte palliata). Además, existen unas 300 especies de aves, como la urraca copetona (Calocitta formosa), el perico frentinaranja o catano (Aratinga canicularis) y el gavilán cangrejero (Buteogallus anthracinus), unas 100 de anfibios y reptiles y, se estima que pueden haber más de 30.000 de insectos, entre los que más de 5.000 serían especies de mariposas diurnas y nocturnas.
Las bellas playas Naranjo y Nancite son importantes lugares de desove para las tortugas marinas, principalmente loras (Lepidochelys olivacea), baulas (Dermochelys coriacea) - la más grande de todas - y verdes del Pacífico (Chelonia agassizi). En Nancite tienen lugar las mayores arribadas de tortugas loras de toda la América Tropical; aquí se localiza una estación biológica. Otras especies abundantes en las playas son las almejas (Donax sp.), los caracoles (Olivella sp.) y los cangrejos fantasma (Ocypode gaudichaudii), violinista (Uca sp.), ermitaño (Coenobita compressa), jaiba (Callinectes arcutus) y topo (Emerita sp.).
En las costas rocosas. A lo largo de la península Santa Elena, se observan algas verdes (Enteromorpha spp.), moluscos como las cascos de mula (Siphonaria gigas) y las cucarachas de mar (Chiton stokesii), y equinodermos como los pepinos de mar (Holothuria sp.). La playa Naranjo presenta condiciones ideales para practicar el “surf”.
La sección Santa Rosa es una de las áreas de mayor importancia histórica del país. El Museo Histórico de La Casona y los corrales de piedra que aquí se pueden admirar, proceden de la época colonial y fueron escenario de la batalla del 20 de marzo de 1856 contra los filibusteros, en defensa de la soberanía nacional.
La península de Santa Elena es el área más seca y más vieja del país; se trata de un afloramiento de peridotote, una roca ígnea intrusita que, en este caso, tiene unos 85 millones de años de antigüedad. La isla Bolaños, situado al norte de esta península y parte del Parque Santa Rosa, es un peñón de 81 m de altura, de forma ovalada y topografía irregular, situada a 1,5 Km. de la costa de punta Descartes.
Esta isla tiene especial importancia para la conservación de la s aves, ya que protege una de las pocas áreas que se conocen en el país donde nidifican sobre su escasa vegetación, colonias de pelícanos pardos (Pelecanus occidentalis), con un total de 500 a 600 ejemplares y, la única hasta ahora descubierta, donde nidifican las tijeretas de mar (Fregata magnificens), con unos 1000 individuos y los ostreros americanos (Haematopus palliatus).
En el Parque Nacional Guanacaste se localizan las Estaciones Biológicos Cacao, Maritza y Pitilla. La Estación Biológica de Cacao se encuentra en las faldas de este volcán, de 1.659 m de altitud. El Cacao es un estrato volcán que no ha presentado actividad en miles de años. Se observan en este macizo bosques húmedos siempre verdes y bosques nublados de vegetación achaparrada, con una notable abundancia de orquídeas y helechos. La estación se encuentra a unos 1000 m de altitud y está acondicionada para alojar hasta 30 personas; cuenta con agua potable y radiocomunicación, y es de acceso restringido.
Este sitio se encuentra a 51 Km. de Liberia, vía carretera Panamericana - Quebrada Grande - Góngora - estación, por caminos en parte pavimentados y parte de tierra. Desde esta estación salen senderos que conducen a El Pedregal, a la cima del volcán y la Estación Maritza. Existe un servicio de autobuses Liberia - Quebrada Grande; en esta última población hay pulperías.
La estación Biológica Maritza se encuentra en las faldas del volcán Orosí, de 1,446 m de altitud. El Orosí es un estrato volcán de forma cónica bien desarrollada; su cráter se encuentra muy destruido y no ha presentado actividad en cientos o miles de años. Las faldas de este macizo están totalmente cubiertas por bosques húmedos y nubosos muy densos y en las partes más bajas se observan bosques secos y de galería. En este macizo nace el río Tempisque, uno de los más largos e importantes - como fuente de agua para irrigación - del país.
De gran interés cultural en las inmediaciones de la estación, es el área conocida como El Pedregal, donde se pueden observar cientos de petroglifos. La estación, que se encuentra a 650 m de altitud, está acondicionada para alojar a 32 personas y cuenta con agua potable y radiocomunicación. Este sitio se encuentra a 60 km de Liberia, vía carretera Panamericana - kilómetro 42 - estación, por caminos en parte pavimentados y en parte de tierra.
La estación Biológica Pitilla se encuentra en la vertiente atlántica, a 600 m de altitud y está totalmente rodeada de bosques primarios. En esta zona la precipitación oscila entre 3.000 y 4.000 mm por año y es un lugar excelente para la observación de la avifauna. La estación está acondicionada para a 20 personas y cuenta con agua potable y radiocomunicación. Dos de los senderos existentes se denominan. El Nacho y La Campana. Esta estación se encuentra a 9 km de Santa cecilia, por camino de tierra. Existe un servicio de autobuses Liberia - Santa Cecilia; en esta última población hay pulperías.
El area de Conservación Guanacaste se encuentra al noroeste de la provincia de Guanacaste, cerca de la frontera con Nicaragua. La carretera Panamericana pasa en medio de los Parques Santa Rosa y Liberia (256 km), por carretera pavimentada. Las restantes vías internas son de lastre y tierra por lo que se requiere el uso de vehículos todo terreno. El acceso a la playa Nancite y la isla Bolaños está restringido.
En la sección Santa Rosa se pueden visitar La Casona, que cuenta con un museo, y el monumento mirador que se encuentra detrás de ésta. En esta sección existen los senderos El Indio Desnudo, Aceituno, Los Patos, Carbonal, Valle Naranjo, y Playa Naranjo - Playa Nancite. En la sección Murciélago se halla es sendero cerca del Museo Histórico, con mesas, lavabos y agua potable; en Playa naranjo, Estero Real y Murciélago hay áreas de acampar con mesas, lavabos y agua de pozo no potable.
Cerca de la administración principal se encuentra el Centro de Investigaciones del Bosque Seco Tropical, un importante centro internacional de estudios sobre la ecoloía de este ecosistema, que cuenta con alojamiento para 72 personas, laboratorios, salas de reuniones y biblioteca y está acondicionado con un sistema de ordenadores.
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